Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ChfrQ810L3 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ChfrQ810L3 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ChfrQ810L3 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.5 ms