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Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7
Opn5, Opsin-5, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Opn5
Q6VZZ7
Gm29580-201
ENSMUST00000189921
166 nt
TSL 5
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm28858-201
ENSMUST00000190517
166 nt
TSL 5
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm28210-201
ENSMUST00000190631
166 nt
TSL 5
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm28336-201
ENSMUST00000190743
166 nt
TSL 5
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm29042-201
ENSMUST00000191564
166 nt
TSL 5
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm42935-201
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151 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm43944-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Mir33-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm24030-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Mir8119-201
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BASIC
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□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Olfr865-ps1-201
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BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn5
Q6VZZ7
Gm22451-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm25367-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22466-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22565-201
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BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm24020-201
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BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Snord32a-201
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BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir448-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir500-201
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92 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm10813-201
ENSMUST00000099936
90 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Olfr1100-202
ENSMUST00000117211
2937 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir1899-201
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96 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm24476-201
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131 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
DQ267101-201
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BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Snord60-201
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78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir101a-201
ENSMUST00000083517
83 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm11248-201
ENSMUST00000119568
201 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm24549-201
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139 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm38274-201
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148 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22297-201
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BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22149-201
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BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm6272-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm11250-201
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306 nt
TSL 5
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm25901-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm36956-201
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BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm37998-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
AC136457.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22753-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm25091-201
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
Snord69-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm22384-201
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
Gm26398-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm21954-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm27993-201
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
Trbv25-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm25915-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm23881-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Polr2k-ps-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Gm25623-201
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BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Traj61-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir6394-201
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BASIC
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□□□□□ -2.29
Opn5
Q6VZZ7
Mir695-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm22689-201
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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Q6VZZ7
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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Q6VZZ7
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BASIC
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Q6VZZ7
Gm22708-201
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Q6VZZ7
Mir3109-201
ENSMUST00000175301
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BASIC
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Opn5
Q6VZZ7
CT485607.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
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BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm23301-201
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65 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm22544-201
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127 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm24223-201
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90 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
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222 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm23735-201
ENSMUST00000082551
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BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm25138-201
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136 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm26338-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Traj43-201
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57 nt
APPRIS P1
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm12469-201
ENSMUST00000117623
207 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm24913-201
ENSMUST00000157286
107 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm10548-202
ENSMUST00000165672
272 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm23416-201
ENSMUST00000175520
95 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Mir6364-201
ENSMUST00000183396
86 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm38298-201
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118 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm44301-201
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143 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Olfr880-ps1-201
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229 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
mt-Ts2-201
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59 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
mt-Tt-201
ENSMUST00000082422
67 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm24920-201
ENSMUST00000083018
85 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm26168-201
ENSMUST00000083787
112 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm24842-201
ENSMUST00000158681
54 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm24678-201
ENSMUST00000158756
104 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
1700112D23Rik-202
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TSL 2
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm44458-201
ENSMUST00000196594
143 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm44211-201
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145 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Mir362-201
ENSMUST00000093592
65 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Olfr867-203
ENSMUST00000216538
4617 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm382-201
ENSMUST00000096332
4070 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm25425-201
ENSMUST00000157611
96 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn5
Q6VZZ7
Gm26290-201
ENSMUST00000158891
145 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
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