Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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