Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Gm20809Q62458 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Gm20809Q62458 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Gm20809Q62458 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Gm20809Q62458 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.6 ms