Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ttf1Q62187 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ttf1Q62187 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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Ttf1Q62187 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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Ttf1Q62187 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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Ttf1Q62187 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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Ttf1Q62187 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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Ttf1Q62187 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ttf1Q62187 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ttf1Q62187 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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