Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms