Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2
Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC124739.2-201 | ENSMUST00000222201 | 109 nt | BASIC | -0,29 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | mt-Tc-201 | ENSMUST00000082400 | 66 nt | BASIC | -0,29 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir126a-201 | ENSMUST00000083606 | 73 nt | BASIC | -0,29 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26395-201 | ENSMUST00000104094 | 132 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24132-201 | ENSMUST00000104745 | 91 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24288-201 | ENSMUST00000157630 | 144 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25976-201 | ENSMUST00000158695 | 130 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22476-201 | ENSMUST00000158902 | 100 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | mt-Ta-201 | ENSMUST00000082398 | 69 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mirlet7f-2-201 | ENSMUST00000083668 | 83 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir488-201 | ENSMUST00000093595 | 109 nt | BASIC | -0,3 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC154506.4-201 | ENSMUST00000224898 | 3416 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23060-201 | ENSMUST00000102345 | 109 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22148-201 | ENSMUST00000104445 | 107 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir1197-201 | ENSMUST00000117037 | 120 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm11936-201 | ENSMUST00000118323 | 160 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22967-201 | ENSMUST00000157956 | 239 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26210-201 | ENSMUST00000158680 | 91 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm18665-201 | ENSMUST00000189783 | 270 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm42623-201 | ENSMUST00000197225 | 379 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir6896-201 | ENSMUST00000198033 | 73 nt | BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm6020-201 | ENSMUST00000092094 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,31 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir672-201 | ENSMUST00000102331 | 100 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm11694-201 | ENSMUST00000118637 | 159 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24009-201 | ENSMUST00000157734 | 93 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27579-201 | ENSMUST00000158113 | 63 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25307-201 | ENSMUST00000158885 | 106 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25834-201 | ENSMUST00000158916 | 101 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25328-201 | ENSMUST00000175013 | 107 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm42506-201 | ENSMUST00000202009 | 150 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Olfr1483-ps1-201 | ENSMUST00000208241 | 334 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir196a-2-201 | ENSMUST00000083554 | 85 nt | BASIC | -0,32 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord91a-201 | ENSMUST00000104305 | 93 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25056-201 | ENSMUST00000157372 | 62 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir21b-201 | ENSMUST00000184317 | 108 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir3065-201 | ENSMUST00000198674 | 87 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43927-201 | ENSMUST00000204599 | 117 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord61-201 | ENSMUST00000083176 | 71 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mirlet7c-1-201 | ENSMUST00000083623 | 94 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24256-201 | ENSMUST00000083696 | 84 nt | BASIC | -0,33 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25985-201 | ENSMUST00000122677 | 107 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24903-201 | ENSMUST00000158131 | 126 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26007-201 | ENSMUST00000158798 | 120 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25397-201 | ENSMUST00000176951 | 92 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27297-201 | ENSMUST00000183395 | 105 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23303-201 | ENSMUST00000082714 | 152 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22287-201 | ENSMUST00000083197 | 107 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir302d-201 | ENSMUST00000083513 | 66 nt | BASIC | -0,34 | □□□□□ -2,46 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23654-201 | ENSMUST00000116758 | 126 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22788-201 | ENSMUST00000157876 | 61 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm17020-201 | ENSMUST00000172274 | 274 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27980-201 | ENSMUST00000184094 | 169 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | AC153646.2-201 | ENSMUST00000220516 | 109 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22509-201 | ENSMUST00000082775 | 107 nt | BASIC | -0,35 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22757-201 | ENSMUST00000102279 | 96 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | n-R5s171-201 | ENSMUST00000104128 | 79 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25184-201 | ENSMUST00000157753 | 163 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22838-201 | ENSMUST00000158437 | 99 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26403-201 | ENSMUST00000158500 | 105 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir344-2-201 | ENSMUST00000175446 | 80 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm26398-201 | ENSMUST00000179015 | 127 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir7118-201 | ENSMUST00000197760 | 61 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm43381-201 | ENSMUST00000198553 | 165 nt | BASIC | -0,36 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23126-201 | ENSMUST00000104260 | 134 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir3470a-201 | ENSMUST00000175223 | 77 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm37750-201 | ENSMUST00000193563 | 129 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25797-201 | ENSMUST00000082640 | 107 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23442-201 | ENSMUST00000082919 | 134 nt | BASIC | -0,37 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25756-201 | ENSMUST00000103990 | 136 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25170-201 | ENSMUST00000104191 | 129 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm3788-201 | ENSMUST00000119949 | 136 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm11749-201 | ENSMUST00000127327 | 184 nt | TSL 2 BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25149-201 | ENSMUST00000157119 | 82 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22324-201 | ENSMUST00000158903 | 114 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25160-201 | ENSMUST00000158914 | 102 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir3089-201 | ENSMUST00000175350 | 84 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44458-201 | ENSMUST00000196594 | 143 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm44375-201 | ENSMUST00000196657 | 150 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir1a-2-201 | ENSMUST00000198520 | 72 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Rny1-201 | ENSMUST00000083767 | 112 nt | BASIC | -0,38 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir764-201 | ENSMUST00000103259 | 108 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22673-201 | ENSMUST00000104415 | 131 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Mir1298-201 | ENSMUST00000116681 | 98 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm14947-201 | ENSMUST00000133704 | 303 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25633-201 | ENSMUST00000178565 | 107 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27803-201 | ENSMUST00000183763 | 119 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm38295-201 | ENSMUST00000191951 | 151 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm37889-201 | ENSMUST00000194174 | 251 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm25899-201 | ENSMUST00000082672 | 141 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23445-201 | ENSMUST00000082800 | 107 nt | BASIC | -0,39 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm24232-201 | ENSMUST00000104314 | 132 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm11644-201 | ENSMUST00000119735 | 150 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22431-201 | ENSMUST00000158545 | 107 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22348-201 | ENSMUST00000178674 | 79 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm22951-201 | ENSMUST00000179471 | 107 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm23410-201 | ENSMUST00000179967 | 107 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27285-201 | ENSMUST00000183875 | 127 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Gm27668-201 | ENSMUST00000184188 | 120 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Cr2-206 | ENSMUST00000193801 | 206 nt | TSL 1 (best) BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
Trappc1 | Q5NCF2 | Snord80-202 | ENSMUST00000199023 | 77 nt | BASIC | -0,4 | □□□□□ -2,47 | | |
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