Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,59□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC2,58□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2,57□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2,57□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2,57□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2,57□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2,57□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2,56□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC2,56□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2,56□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2,55□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC2,55□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2,55□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2,55□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC2,55□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC2,54□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2,54□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2,54□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2,54□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2,54□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC2,53□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC2,53□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2,53□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2,53□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2,53□□□□□ -2
Rnf40Q3U319 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,51□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2,5□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2,5□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
Rnf40Q3U319 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2,46□□□□□ -2,02
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