Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Trim71Q1PSW8 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trim71Q1PSW8 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.8 ms