Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd1Q01822 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd1Q01822 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd1Q01822 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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