Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Rpl28P41105 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Rpl28P41105 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Rpl28P41105 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms