Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Rtf1A2AQ19 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Rtf1A2AQ19 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Rtf1A2AQ19 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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