Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Limd1Q9QXD8 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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Limd1Q9QXD8 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm24674-201ENSMUST00000179194 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Limd1Q9QXD8 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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