Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm22069-201ENSMUST00000179911 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rabgef1Q9JM13 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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