Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtaQ9JHK4 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtaQ9JHK4 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtaQ9JHK4 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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