Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Hddc3Q9D114 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Hddc3Q9D114 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Hddc3Q9D114 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 351 ms