Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Zbed3Q9D0L1 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Zbed3Q9D0L1 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms