Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Rprd1bQ9CSU0 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
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