Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Usp38Q8BW70 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp38Q8BW70 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp38Q8BW70 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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