Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC-0,17□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC-0,18□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0,19□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0,2□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0,21□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0,22□□□□□ -2,44
Trappc1Q5NCF2 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0,23□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0,24□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC-0,25□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0,25□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0,25□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0,25□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-0,26□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC-0,26□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0,27□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-0,28□□□□□ -2,45
Trappc1Q5NCF2 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0,29□□□□□ -2,46
Trappc1Q5NCF2 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Trappc1Q5NCF2 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Trappc1Q5NCF2 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0,29□□□□□ -2,46
Trappc1Q5NCF2 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0,29□□□□□ -2,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms