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Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5
Syna, Syncytin-A, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Syna
Q5G5D5
Gm25840-201
ENSMUST00000177821
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24952-201
ENSMUST00000177909
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23682-201
ENSMUST00000178146
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24652-201
ENSMUST00000178223
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22629-201
ENSMUST00000178272
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24021-201
ENSMUST00000178435
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22274-201
ENSMUST00000178441
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22050-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23688-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23944-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm26283-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25452-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23286-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22640-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25984-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25585-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm26374-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24040-201
ENSMUST00000179786
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25017-201
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79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23618-201
ENSMUST00000179912
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm26284-201
ENSMUST00000180107
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24570-201
ENSMUST00000180314
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24654-201
ENSMUST00000180315
79 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm44483-201
ENSMUST00000197203
97 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
AC141438.3-201
ENSMUST00000215632
202 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm26123-201
ENSMUST00000083363
135 nt
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Vmn1r75-202
ENSMUST00000226622
6638 nt
APPRIS P2
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Pcdh11x-208
ENSMUST00000193899
5394 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
1.27
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22451-201
ENSMUST00000122803
151 nt
BASIC
1.26
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22802-201
ENSMUST00000175621
89 nt
BASIC
1.26
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
1700112D23Rik-202
ENSMUST00000193387
299 nt
TSL 2
BASIC
1.26
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Tex15-201
ENSMUST00000009772
8405 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.26
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24865-201
ENSMUST00000103246
96 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25611-201
ENSMUST00000104017
133 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25496-201
ENSMUST00000104430
120 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm12086-201
ENSMUST00000120863
228 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24942-201
ENSMUST00000158328
114 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22200-201
ENSMUST00000158614
67 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Snora24-201
ENSMUST00000174989
130 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25936-201
ENSMUST00000179952
114 nt
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Zfp40-203
ENSMUST00000140313
2754 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.25
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24482-201
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93 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24894-201
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118 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23106-201
ENSMUST00000157554
101 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24238-201
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98 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22862-201
ENSMUST00000178593
121 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm42844-201
ENSMUST00000200355
112 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
AC136457.1-201
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156 nt
BASIC
1.24
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm12013-201
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155 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22559-201
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134 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25011-201
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126 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25715-201
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125 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25838-201
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120 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25241-201
ENSMUST00000174909
84 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm26217-201
ENSMUST00000175212
84 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22070-201
ENSMUST00000178475
107 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm37330-201
ENSMUST00000192606
153 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm44462-201
ENSMUST00000199696
129 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm44807-201
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154 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Snora41-201
ENSMUST00000082668
132 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm44240-201
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2654 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22196-201
ENSMUST00000116865
109 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm24913-201
ENSMUST00000157286
107 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm23763-201
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60 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25646-201
ENSMUST00000178527
79 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Mir6377-201
ENSMUST00000183760
114 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
AC133083.2-201
ENSMUST00000222826
272 nt
TSL 5
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm22509-201
ENSMUST00000082775
107 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Snord1a-201
ENSMUST00000083160
74 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
Syna
Q5G5D5
Gm25541-201
ENSMUST00000116888
126 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm22031-201
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126 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm23893-201
ENSMUST00000158106
134 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm26363-201
ENSMUST00000158866
83 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm22929-201
ENSMUST00000175517
107 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
AC126939.1-201
ENSMUST00000224943
226 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
mt-Ts2-201
ENSMUST00000082416
59 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir92-2-201
ENSMUST00000083679
91 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir466-201
ENSMUST00000093591
73 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm22772-201
ENSMUST00000104451
121 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm26498-201
ENSMUST00000177799
79 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm26230-201
ENSMUST00000180141
79 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
AC147560.1-201
ENSMUST00000197528
107 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir211-201
ENSMUST00000083651
106 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm25684-201
ENSMUST00000083941
107 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm24234-201
ENSMUST00000104316
107 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm25329-201
ENSMUST00000158041
126 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm23419-201
ENSMUST00000175523
84 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir6369-201
ENSMUST00000183772
106 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir7663-201
ENSMUST00000183950
61 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm27365-201
ENSMUST00000184041
177 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm43324-201
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289 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
AC158598.2-201
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BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm25650-201
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162 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Mir1904-201
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80 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
n-R5s63-201
ENSMUST00000122756
103 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm22815-201
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62 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm23838-201
ENSMUST00000158067
162 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
AC160550.1-201
ENSMUST00000228659
181 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm23507-201
ENSMUST00000083078
107 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Syna
Q5G5D5
Gm24494-201
ENSMUST00000083804
81 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
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