Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC2,74□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,73□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2,72□□□□□ -1,97
Rnf40Q3U319 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC2,71□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC2,71□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2,71□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2,71□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2,7□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2,69□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2,68□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2,67□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2,67□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2,67□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC2,67□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC2,67□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,66□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2,65□□□□□ -1,98
Rnf40Q3U319 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2,65□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2,64□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2,64□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC2,64□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2,64□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2,63□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2,63□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2,63□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2,63□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2,63□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,62□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,61□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC2,6□□□□□ -1,99
Rnf40Q3U319 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2,6□□□□□ -1,99
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