Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trim71Q1PSW8 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Trim71Q1PSW8 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Trim71Q1PSW8 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms