Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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Sh3bp2Q06649 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Sh3bp2Q06649 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Sh3bp2Q06649 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.5 ms