Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 n-R5s153-201ENSMUST00000083451 116 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23613-201ENSMUST00000082596 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprmP28828 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprmP28828 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprmP28828 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprmP28828 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprmP28828 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms