Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RxraP28700 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RxraP28700 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RxraP28700 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RxraP28700 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RxraP28700 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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