Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Nedd9O35177 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nedd9O35177 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Nedd9O35177 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms