Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Spocd1B1ASB6 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spocd1B1ASB6 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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