Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Grik3B1AS29 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Grik3B1AS29 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Grik3B1AS29 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.4 ms