Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0,96□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0,97□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0,97□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0,97□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC-0,97□□□□□ -2,56
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC-0,98□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-0,99□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-1□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-1,01□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC-1,02□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-1,03□□□□□ -2,57
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-1,04□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-1,05□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-1,06□□□□□ -2,58
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-1,07□□□□□ -2,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114,3 ms