Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Limd1Q9QXD8 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Limd1Q9QXD8 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Limd1Q9QXD8 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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