Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1Q9JM13 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22679-201ENSMUST00000116975 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
Rabgef1Q9JM13 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Rabgef1Q9JM13 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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