Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Smg9Q9DB90 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir34c-201ENSMUST00000083653 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Smg9Q9DB90 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Mir1187-201ENSMUST00000116936 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm22067-201ENSMUST00000122790 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Smg9Q9DB90 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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