Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm22887-201ENSMUST00000178586 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Shmt2Q9CZN7 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Shmt2Q9CZN7 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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