Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PtprtQ99M80 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.79□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PtprtQ99M80 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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PtprtQ99M80 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
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PtprtQ99M80 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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PtprtQ99M80 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
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PtprtQ99M80 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
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PtprtQ99M80 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
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PtprtQ99M80 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm22566-201ENSMUST00000175541 85 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.9□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PtprtQ99M80 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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