Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-1,37□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-1,38□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC-1,39□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-1,4□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,63
NipblQ6KCD5 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC-1,41□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-1,42□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,42□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC-1,42□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir470-201ENSMUST00000093565 75 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-1,43□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir297a-3-201ENSMUST00000103768 102 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-1,44□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC-1,45□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC-1,46□□□□□ -2,64
NipblQ6KCD5 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC-1,46□□□□□ -2,64
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