Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnf40Q3U319 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnf40Q3U319 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnf40Q3U319 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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