Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ptchd1Q14B62 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ptchd1Q14B62 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ptchd1Q14B62 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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