Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Hif3aQ0VBL6 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Hif3aQ0VBL6 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Hif3aQ0VBL6 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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