Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Itgb8Q0VBD0 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Itgb8Q0VBD0 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms