Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sh3bp2Q06649 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Sh3bp2Q06649 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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Sh3bp2Q06649 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Sh3bp2Q06649 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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Sh3bp2Q06649 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sh3bp2Q06649 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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Sh3bp2Q06649 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sh3bp2Q06649 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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