Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd1Q01822 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.4 ms