Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtbP53612 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtbP53612 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtbP53612 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RabggtbP53612 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RabggtbP53612 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RabggtbP53612 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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