Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
Rpl28P41105 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Rpl28P41105 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Rpl28P41105 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Rpl28P41105 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Rpl28P41105 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Rpl28P41105 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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