Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprmP28828 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprmP28828 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprmP28828 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PtprmP28828 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PtprmP28828 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PtprmP28828 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PtprmP28828 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm27944-201ENSMUST00000185155 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
PtprmP28828 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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