Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RxraP28700 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RxraP28700 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RxraP28700 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RxraP28700 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RxraP28700 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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