Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2,54□□□□□ -2
ArxO35085 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC2,54□□□□□ -2
ArxO35085 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2,54□□□□□ -2
ArxO35085 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC2,54□□□□□ -2
ArxO35085 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC2,54□□□□□ -2
ArxO35085 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2,53□□□□□ -2
ArxO35085 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2,53□□□□□ -2
ArxO35085 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC2,53□□□□□ -2
ArxO35085 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC2,53□□□□□ -2
ArxO35085 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC2,53□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC2,52□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,51□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
ArxO35085 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
ArxO35085 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2,5□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2,49□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
ArxO35085 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2,48□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC2,47□□□□□ -2,01
ArxO35085 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2,47□□□□□ -2,01
ArxO35085 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2,46□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2,46□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC2,46□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC2,46□□□□□ -2,02
ArxO35085 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC2,46□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2,45□□□□□ -2,02
ArxO35085 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2,45□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2,45□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2,45□□□□□ -2,02
ArxO35085 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2,44□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2,43□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2,43□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2,43□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC2,43□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2,43□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2,42□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2,42□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2,41□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2,41□□□□□ -2,02
ArxO35085 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2,41□□□□□ -2,02
ArxO35085 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,4□□□□□ -2,03
ArxO35085 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2,39□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2,39□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2,38□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2,37□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,36□□□□□ -2,03
ArxO35085 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2,35□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2,35□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2,35□□□□□ -2,03
ArxO35085 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC2,35□□□□□ -2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89,2 ms