Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc6D3YZP9 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc6D3YZP9 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc6D3YZP9 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc6D3YZP9 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms