Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trabd2bB1ATG9 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Trabd2bB1ATG9 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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