Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Spocd1B1ASB6 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Spocd1B1ASB6 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Spocd1B1ASB6 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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